« Parmi toutes les lignées d’Omicron, c’est celle qui montre une augmentation la plus élevée de cas. Mais nous devons être prudents dans l’interprétation de cela, car des augmentations plus élevées à partir d’un nombre très faible sont plus faciles à observer », a déclaré Ramon Lorenzo-Redondo, assistant. professeur de médecine pour les maladies infectieuses à la Northwestern University Feinberg School of Medicine à Chicago.
Comme la version plus familière d’Omicron, BA.2 a un grand nombre de changements – environ 20 – concentrés dans la protéine de pointe, la partie du virus ciblée par les vaccins.
Contrairement à Omicron, cependant, il ne provoque pas une certaine signature sur les tests de laboratoire appelée échec de la cible du gène s, ce qui signifie qu’il peut ressembler à d’autres variantes du SRAS-CoV-2 sur un premier écran. Certains l’appellent « la variante furtive ».
Mais Lorenzo-Redondo dit que ce surnom a amené les gens à penser qu’il ne peut pas être détecté dans les tests de laboratoire, ce qui n’est pas le cas.
« Il y a eu des messages déroutants à ce sujet. Les tests en laboratoire et à domicile approuvés par la FDA devraient détecter cette lignée, ainsi que l’autre Omicron (sous-lignée), BA.1 », a-t-il déclaré.
La version du virus que les chercheurs ont nommée Omicron comprend plusieurs familles virales. La famille BA.1 est celle qui cause presque toutes les infections à Omicron aux États-Unis. Maintenant, une deuxième famille, le clade BA.2, commence à gagner du terrain dans d’autres pays, notamment l’Inde et le Danemark.
BA.2 a également été récupéré en Afrique du Sud et au Royaume-Uni, où il a été désigné comme une variante faisant l’objet d’une enquête par la Health Security Agency du Royaume-Uni. Une variante faisant l’objet d’une enquête est une variante qui se propage dans le pays et qui est surveillée car elle peut se propager plus facilement d’une personne à l’autre ou avoir des caractéristiques qui la rendent plus résistante aux traitements ou aux vaccins.
Aux États-Unis, environ 100 cas causés par BA.2 ont été signalés dans au moins 20 États, selon le site Web de partage de séquences GISAID.org.
BA.2 représente actuellement moins de 1 % des cas de Covid-19 aux États-Unis, selon Outbreak.info, un projet de données de Scripps Research.
Au Houston Methodist Hospital au Texas, les chercheurs séquencent les génomes viraux de chaque cas positif de Covid-19 qu’ils trouvent. Sur plus de 4 000 génomes séquencés depuis le premier de l’année, ils n’ont trouvé que trois cas de la sous-lignée BA.2, a déclaré le Dr Wesley Long, directeur médical de la microbiologie.
Va-t-il décoller ici comme il l’a fait en Inde et au Danemark ? « Je pense qu’il est encore trop tôt pour le dire », dit Long.
Les virus changent ou mutent tout le temps. La plupart de ces changements ne sont pas nocifs. Mais occasionnellement, un virus changera d’une manière qui l’aidera à devenir plus compétitif. Il peut, par exemple, se transmettre plus rapidement d’un hôte à l’autre ou se lier plus facilement aux cellules.
Long dit qu’il est difficile de savoir pourquoi BA.2 gagne du terrain dans certains pays. Il se peut qu’il ait un certain avantage par rapport à la variante originale d’Omicron, ou peut-être que BA.1 et BA.2 ont été introduits à peu près au même moment, de sorte qu’ils ont pu se propager à peu près au même rythme.
Mais il dit que les scientifiques surveilleront ces pays de près pour voir comment la situation évoluera au cours des prochaines semaines.
Les scientifiques disent que la nouvelle retombée d’Omicron n’est pas surprenante et, en fait, était anticipée, étant donné qu’environ la moitié de la population mondiale n’a toujours pas été vaccinée contre le coronavirus.
« Je serais très surprise, avec l’état actuel de la population mondiale en termes de statut immunitaire, si nous ne voyions pas plus de variantes émerger », déclare Angela Rasmussen, virologue à la Vaccine and Infectious Disease Organization de l’Université de Saskatchewan.
Correction: Cette histoire a été modifiée pour noter que, bien qu’Omicron ait été détecté fin novembre, les variantes BA.1 et BA.2 ont été distinguées et nommées début décembre.